Là một huyện có địa hình đồi núi đa dạng, không đồng đều, chải dài theo sườn phía Tây và phía Tây Nam là dãy núi Tam Điệp. Địa hình dốc đổ dần từ Tây Bắc xuống Đông Nam. Và có hệ thống giao thông rất thuận tiện.
Phía Đông giáp với huyện Kim Sơn, phía Đông Bắc giáp huyện Yên Khánh
Phía Tây giáp thành phố Tam Điệp
Phía Nam giáp với hai huyện Hà Trung và Nga Sơn của tỉnh Thanh Hóa
Phía Bắc giáp với huyện Hoa Lư
Với vị trí địa lí đặc biệt, huyện Yên Mô là một điểm đến thú vị du khách không nên bỏ qua khi tới vùng đất Cố Đô